Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DBF4Q9UBU7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms