Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHPF2Q9P2E5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms