Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms