Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms