Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC59Q9P031 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms