Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP5Q9NZZ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms