Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN9

AIPL1, Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIPL1Q9NZN9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIPL1Q9NZN9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIPL1Q9NZN9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms