Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC3Q9NYG2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZDHHC3Q9NYG2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms