Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms