Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAH9Q9NYC9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAH9Q9NYC9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms