Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms