Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MS4A12Q9NXJ0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms