Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH5Q9NX47 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms