Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL11Q9NVR0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms