Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMBRD1Q9NUN5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms