Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP8A2Q9NTI2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms