Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms