Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
OTORQ9NRC9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OTORQ9NRC9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms