Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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CNGB3Q9NQW8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNGB3Q9NQW8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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