Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP2Q9NPB3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP2Q9NPB3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms