Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms