Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC86Q9H6F5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms