Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNDC4Q9H6D8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms