Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
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