Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF3Q9H094 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF3Q9H094 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms