Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms