Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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