Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCL11BQ9C0K0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCL11BQ9C0K0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms