Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms