Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM7Q9C029 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms