Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms