Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms