Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIFKQ9BYG3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms