Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPL3Q9BY60 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms