Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms