Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms