Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS2Q9BXC9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS2Q9BXC9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms