Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRIP1Q9BX63 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms