Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSM14BQ9BX40 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms