Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKNK1Q9BUB5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms