Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRDL1Q9BU40 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms