Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms