Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRADC1Q9BSG0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms