Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP3BQ9BS92 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms