Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SRSF8Q9BRL6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms