Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RETNLBQ9BQ08 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms