Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3CQ99985 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms