Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms