Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX2Q99697 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms