Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms